Sejak awal pandemik, ujian diagnostik telah memainkan peranan penting dalam mengawal penyebaran SARS-CoV-2, virus yang menyebabkanCOVID 19.Ujian antigen pantasdilakukan di rumah atau dalam keadaan klinikal memberikan hasil dalam 15 minit atau kurang.Lebih awal seseorang itu didiagnosis, lebih cepat mereka boleh mendapatkan rawatan perubatan dan mengasingkan diri daripada orang lain.Tetapi apabila varian baharu virus muncul, varian tersebut mungkin tidak dapat dikesan oleh ujian ini.
Kebanyakan ujian antigen pantas direka untuk mengesan protein nukleokapsid SARS-CoV-2 atau N-protein.Protein ini didapati dengan banyaknya dalam zarah virus dan orang yang dijangkiti.Kit ujian pantass biasanya mengandungi dua antibodi diagnostik berbeza yang mengikat bahagian berlainan protein N.Apabila antibodi mengikat protein N dalam sampel, garis berwarna atau isyarat lain muncul pada kit ujian, menunjukkan jangkitan.
Protein N terdiri daripada 419 unit struktur asid amino.Mana-mana daripada mereka boleh digantikan oleh asid amino lain melalui mutasi.Kumpulan penyelidikan yang diketuai oleh Ph.D.Philip Frank dan Eric Ortlund dari Emory University berusaha untuk menyiasat bagaimana perubahan asid amino tunggal ini mempengaruhi prestasi ujian antigen pantas.Mereka menggunakan teknik yang dipanggil pengimbasan mutasi dalam untuk menilai secara serentak cara setiap mutasi dalam protein N virus mempengaruhi pengikatan kepada antibodi diagnostik.Keputusan mereka diterbitkan dalam Sel pada 15 September 2022.
Para penyelidik mencipta perpustakaan komprehensif yang mengandungi hampir 8,000 N mutasi protein.Varian ini menyumbang lebih daripada 99.5% daripada semua mutasi yang mungkin.Mereka kemudian menilai bagaimana setiap varian berinteraksi dengan 17 antibodi diagnostik berbeza yang digunakan dalam 11 ujian antigen pantas yang tersedia secara komersial, termasuk ujian biasa.kit rumah.
Pasukan menilai mutasi N-protein yang mempengaruhi pengecaman antibodi.Berdasarkan maklumat ini, mereka mencipta "profil mutasi melarikan diri" untuk setiap antibodi diagnostik.Profil ini mengenal pasti mutasi tertentu dalam protein N yang mungkin menjejaskan keupayaan antibodi untuk mengikat sasarannya.Analisis menunjukkan bahawa antibodi yang digunakan dalam ujian pantas hari ini mengenali dan mengikat semua varian SARS-CoV-2 masa lalu dan sekarang yang membimbangkan dan membimbangkan.
Walaupun beberapa antibodi diagnostik mengiktiraf kawasan protein N yang sama, para penyelidik mendapati bahawa setiap antibodi mempunyai tandatangan unik mutasi melarikan diri.Memandangkan virus SARS-CoV-2 terus bermutasi dan menjana varian baharu, data ini boleh digunakan untuk menandakan antibodi kit ujian yang mungkin perlu dinilai semula.
"Pengenalpastian yang tepat dan cekap bagi individu yang dijangkiti kekal sebagai strategi kritikal untuk mitigasi COVID-19, dan kajian kami menyediakan maklumat tentang mutasi SARS-CoV-2 masa depan yang boleh mengganggu pengesanan," kata Ortlund."Keputusan yang digariskan di sini membolehkan kami menyesuaikan diri dengan pantas dengan virus ini kerana varian baharu terus muncul, memberikan implikasi kesihatan klinikal dan awam serta-merta."
Latar Belakang: Mutation Deep Scan mengesan mutasi melarikan diri dalam nukleokapsid SARS-CoV-2 menggunakan ujian antigen pantas yang tersedia pada masa ini.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, sel Ortlund EA.2022 September 15;185(19):3603-3616.e13.Kementerian Dalam Negeri: 10.1016/j.sel.2022.08.010.29 Ogos 2022 PMID: 36084631.
Pembiayaan: Institut Kebangsaan Pengimejan Bioperubatan dan Kejuruteraan Bio NIH (NIBIB), Institut Diabetes, Pencernaan dan Penyakit Ginjal Kebangsaan (NIDDK) dan Institut Alergi dan Penyakit Berjangkit Kebangsaan (NIAID), Persatuan Jantung Amerika.
Perkara Penyelidikan NIH ialah kemas kini mingguan penemuan penyelidikan NIH utama yang disemak oleh pakar NIH.Ia diterbitkan oleh Pejabat Komunikasi dan Hal Ehwal Awam Pengarah Institut Kesihatan Nasional.